该系统依托分子溯源网络平台，基于多源系统融合的PFGE数据特征聚类暴发识别分析技术，能够为疾控工作全流程信息化手段建设与贯通打下产品技术基础。 系统通过融合病例监测报告系统病例数据，采用统计聚类分析技术、基线判断与趋势评估方法，实现基于沙门氏菌等10类菌株的多种酶切特征数据的食源性疾病疑似暴发事件识别，同时具备暴发事件管理、流调状态登记管理以及分析图表数据离线输出等暴发识别综合管理功能。
通过随机抽样的形式，对家庭或学生群体进行食物消费情况的调查，本系统可通过移动端进行数据采集，通过web端进行数据管理与统计，最终实现评估全省的食物消费情况的目的。食物消费调查系统中重点功能主要包括食品库管理，食物消费调查录入，食物消费调查上报，食物消费调查审核，统计分析和问卷管理。
食品化学污染物监测报告系统有助于提高全省食品污染物监测的工作效率 , 可实现及时有效地监测数据上报、实时数据管理查询、在线统计及数据分析等功能 , 也可以实现与其它食源性数据库的数据交流和整合 , 加快监测信息的信息化、规范化、标准化的步伐 , 有助于污染物监测工作进一步的发展。医院账户拥有病例信息录入、采样信息录入、网络上报、信息召回、查询、批量导入导出等功能的权限。
食品微生物监测系统是主要是更为详尽地掌握湖区域内主要食品中微生物的污染水平、历史基线、分布态势和发展趋势，及时发现食品安全隐患，提供周期性计划制定等辅助决策能力，为食品安全风险评估、风险预警、标准制修订和采取有针对性的控制措施提供科学依据和技术手段，有效监测和应对我国食品微生物污染问题。
食源性疾病监测报告系统是以获取实时食源性病例为基础，用户设置预警阈值为标准，通过系统自动实时运算数据主动完成预警的数据上报分析管理平台。通过对全国范围内采集到的监测数据进行分类、加工、存储、监控以及多维度的统计分析，达到对相关的食品、人群、食源性疾病等多维度评估、监测、分析、预警，最终实现问题病源、问题食品和致病因子的溯源目标，达到没发生的提前预警，已发生的早发现早控制的目的，避免更大范围的食源性疾病聚集、非聚集的事件爆发，提高对食源性疾病的监测预警能力
